Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOQ99835 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOQ99835 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOQ99835 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOQ99835 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOQ99835 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOQ99835 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOQ99835 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMOQ99835 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMOQ99835 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOQ99835 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOQ99835 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOQ99835 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOQ99835 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOQ99835 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOQ99835 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOQ99835 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMOQ99835 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOQ99835 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOQ99835 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOQ99835 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOQ99835 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOQ99835 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMOQ99835 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMOQ99835 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMOQ99835 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMOQ99835 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMOQ99835 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMOQ99835 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMOQ99835 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOQ99835 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOQ99835 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOQ99835 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOQ99835 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOQ99835 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOQ99835 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOQ99835 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOQ99835 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMOQ99835 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMOQ99835 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMOQ99835 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMOQ99835 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMOQ99835 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMOQ99835 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMOQ99835 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMOQ99835 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMOQ99835 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMOQ99835 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMOQ99835 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOQ99835 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOQ99835 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOQ99835 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOQ99835 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOQ99835 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMOQ99835 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOQ99835 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOQ99835 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOQ99835 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOQ99835 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOQ99835 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOQ99835 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMOQ99835 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMOQ99835 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms