Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPEPQ99797 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPEPQ99797 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIPEPQ99797 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms