Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAD9AQ99638 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD9AQ99638 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms