Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNQ99608 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNQ99608 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNQ99608 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDNQ99608 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNQ99608 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNQ99608 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNQ99608 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNQ99608 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNQ99608 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNQ99608 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDNQ99608 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDNQ99608 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDNQ99608 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDNQ99608 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDNQ99608 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDNQ99608 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDNQ99608 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDNQ99608 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNQ99608 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNQ99608 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNQ99608 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNQ99608 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNQ99608 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNQ99608 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDNQ99608 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNQ99608 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNQ99608 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNQ99608 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNQ99608 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNQ99608 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNQ99608 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNQ99608 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDNQ99608 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNQ99608 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNQ99608 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNQ99608 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNQ99608 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDNQ99608 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNQ99608 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNQ99608 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNQ99608 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNQ99608 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNQ99608 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNQ99608 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNQ99608 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDNQ99608 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDNQ99608 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNQ99608 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNQ99608 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNQ99608 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNQ99608 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNQ99608 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNQ99608 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNQ99608 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDNQ99608 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDNQ99608 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NDNQ99608 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDNQ99608 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDNQ99608 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDNQ99608 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDNQ99608 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms