Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX18Q96RF0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms