Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPRD1AQ96P16 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPRD1AQ96P16 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPRD1AQ96P16 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms