Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPM1MQ96MI6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPM1MQ96MI6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms