Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF6Q96J87 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CELF6Q96J87 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms