Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VSIG2Q96IQ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VSIG2Q96IQ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms