Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3YL1Q96HL8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3YL1Q96HL8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms