Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF31Q96EP0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF31Q96EP0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF31Q96EP0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms