Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NMD3Q96D46 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NMD3Q96D46 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms