Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCTD12Q96CX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCTD12Q96CX2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms