Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NXPE3Q969Y0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms