Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Alpk3Q924C5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Alpk3Q924C5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Alpk3Q924C5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Alpk3Q924C5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Alpk3Q924C5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Alpk3Q924C5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Alpk3Q924C5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Alpk3Q924C5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Alpk3Q924C5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Alpk3Q924C5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Alpk3Q924C5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Alpk3Q924C5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Alpk3Q924C5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Alpk3Q924C5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Alpk3Q924C5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms