Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rrp1bQ91YK2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rrp1bQ91YK2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms