Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN6

Ddx41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx41Q91VN6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx41Q91VN6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx41Q91VN6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx41Q91VN6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx41Q91VN6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx41Q91VN6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx41Q91VN6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx41Q91VN6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx41Q91VN6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx41Q91VN6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx41Q91VN6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx41Q91VN6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx41Q91VN6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms