Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPS9Q8WXC6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms