Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC13A3Q8WWT9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms