Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TWIST2Q8WVJ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TWIST2Q8WVJ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms