Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mark1Q8VHJ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mark1Q8VHJ5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms