Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk8Q8R3L8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk8Q8R3L8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk8Q8R3L8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms