Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CA13Q8N1Q1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA13Q8N1Q1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms