Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defb12Q8K4N3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Defb12Q8K4N3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms