Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf13Q8K2W6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf13Q8K2W6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Phf13Q8K2W6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1266.4 ms