Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shtn1Q8K2Q9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Shtn1Q8K2Q9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shtn1Q8K2Q9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms