Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkn3Q8K045 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pkn3Q8K045 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn3Q8K045 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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