Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PARP9Q8IXQ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms