Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PASD1Q8IV76 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PASD1Q8IV76 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PASD1Q8IV76 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms