Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tcerg1Q8CGF7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tcerg1Q8CGF7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcerg1Q8CGF7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcerg1Q8CGF7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms