Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc28aQ8CEI3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms