Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Usp27Q8CEG8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp27Q8CEG8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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