Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrrc9Q8CDN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lrrc9Q8CDN9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrrc9Q8CDN9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms