Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Spef2Q8C9J3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Spef2Q8C9J3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms