Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbrd2Q8C561 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmbrd2Q8C561 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbrd2Q8C561 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd2Q8C561 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms