Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sfrp1Q8C4U3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sfrp1Q8C4U3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp1Q8C4U3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms