Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPI1

Dnaaf2, Protein kintoun, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf2Q8BPI1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnaaf2Q8BPI1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnaaf2Q8BPI1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnaaf2Q8BPI1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnaaf2Q8BPI1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnaaf2Q8BPI1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnaaf2Q8BPI1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnaaf2Q8BPI1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnaaf2Q8BPI1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnaaf2Q8BPI1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaaf2Q8BPI1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms