Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA2

Slc41a1, Solute carrier family 41 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc41a1Q8BJA2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc41a1Q8BJA2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms