Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhot1Q8BG51 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhot1Q8BG51 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhot1Q8BG51 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms