Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc50Q810U5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc50Q810U5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc50Q810U5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms