Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZM7

Gtf2a2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a2Q80ZM7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2a2Q80ZM7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf2a2Q80ZM7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2a2Q80ZM7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms