Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pja2Q80U04 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pja2Q80U04 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pja2Q80U04 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 366.8 ms