Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTU1Q7Z7A3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTU1Q7Z7A3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTU1Q7Z7A3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTU1Q7Z7A3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms