Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc93Q7TQK5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc93Q7TQK5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc93Q7TQK5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms