Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim17Q7TPM3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim17Q7TPM3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim17Q7TPM3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim17Q7TPM3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms