Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmc8Q7TN58 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmc8Q7TN58 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmc8Q7TN58 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms