Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SyncripQ7TMK9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SyncripQ7TMK9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms