Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CASC2Q6XLA1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms