Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC171Q6TFL3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC171Q6TFL3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms