Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL17Q6TDP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL17Q6TDP4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL17Q6TDP4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL17Q6TDP4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL17Q6TDP4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL17Q6TDP4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL17Q6TDP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL17Q6TDP4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms